Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms