Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG1Q8WVM7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG1Q8WVM7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms