Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GIPC3Q8TF64 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms