Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms