Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL22A1Q8NFW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL22A1Q8NFW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms