Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHDC9Q8NEP7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms