Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC112Q8NEF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC112Q8NEF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms