Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TTC16Q8NEE8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TTC16Q8NEE8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC16Q8NEE8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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