Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARMIL3Q8ND23 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms