Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KBTBD3Q8NAB2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KBTBD3Q8NAB2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms