Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC155Q8N6L0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms