Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RNF182Q8N6D2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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