Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms