Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLASRPQ8N2M8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLASRPQ8N2M8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms