Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00528Q8N1L1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00528Q8N1L1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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