Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL3Q8IZI9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNL3Q8IZI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms