Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX4Q8IY92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLX4Q8IY92 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms