Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX29P2Q8IUI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms