Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLASP1Q7Z460 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CLASP1Q7Z460 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLASP1Q7Z460 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms