Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP43Q70EL4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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USP43Q70EL4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP43Q70EL4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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