Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf139Q6ZV77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf139Q6ZV77 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms