Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BEND4Q6ZU67 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BEND4Q6ZU67 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms