Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00299Q6ZSB3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms