Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI2Q6ZQN5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms