Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms