Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms