Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms