Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SLC4A10Q6U841 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A10Q6U841 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms