Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSSK4Q6SA08 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms