Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP5Q6NZY7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms