Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD54Q6NXT1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms