Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms