Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REEP3Q6NUK4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REEP3Q6NUK4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms