Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTL6Q6ICC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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