Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCTP1Q6DN14 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms