Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms