Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms