Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WSCD1Q658N2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms