Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL1Q5VZK9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms