Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms