Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATRNL1Q5VV63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms