Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MYOM3Q5VTT5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MYOM3Q5VTT5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms