Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RIF1Q5UIP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIF1Q5UIP0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms