Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAD1Q5T700 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms