Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNAPC4Q5SXM2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms