Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD3Q5JV73 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms