Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOM1Q5C9Z4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOM1Q5C9Z4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms