Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ODF2Q5BJF6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODF2Q5BJF6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms