Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP29Q52LW3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms