Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP28Q4G0W2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms